[{"data":1,"prerenderedAt":-1},["ShallowReactive",2],{"dispatch-exceptions":3,"glossary-degradation-edman":6},{"skip":4,"extra":5},[],[],{"id":7,"slug":8,"term":9,"definition":10,"related_product_ids":11,"related_resource_ids":12,"meta_description":13,"term_i18n":14,"definition_i18n":18,"status":22,"created_at":23,"updated_at":24,"meta_description_i18n":25,"brand":29,"relatedProducts":30,"relatedResources":31,"relatedArticles":32},"b2fc7acf-a505-430f-a26a-422233117f3f","degradation-edman","Dégradation d'Edman","La \u003Cstrong>dégradation d'Edman\u003C/strong> est une \u003Cem>méthode chimique de séquençage N-terminal\u003C/em> des peptides et protéines, développée par le biochimiste suédois \u003Cem>Pehr Edman\u003C/em> en 1950. Elle repose sur le clivage séquentiel, cycle par cycle, du résidu N-terminal d'un peptide sans endommager le reste de la chaîne, permettant l'identification des 30 à 50 premiers acides aminés d'une séquence polypeptidique.\n\n\u003Cstrong>Principe chimique\u003C/strong>. Chaque cycle d'Edman comprend trois étapes : (1) \u003Cem>couplage\u003C/em> — l'isothiocyanate de phényle (\u003Cstrong>PITC\u003C/strong>, réactif d'Edman) réagit avec l'amine libre N-terminale en milieu basique (triméthylamine ou pyridine) pour former un \u003Cem>phénylthiocarbamate\u003C/em> (PTC) ; (2) \u003Cem>clivage\u003C/em> — l'acide trifluoroacétique (\u003Cem>TFA anhydre\u003C/em>) induit la cyclisation intramoléculaire avec l'azote du peptide et libère le résidu N-terminal sous forme d'\u003Cem>anilinothiazolinone\u003C/em> (ATZ) ; (3) \u003Cem>conversion et identification\u003C/em> — l'ATZ instable est converti en \u003Cem>phénylthiohydantoïne\u003C/em> (PTH) stable par chauffage en milieu acide aqueux, puis le dérivé PTH-aminoacide est identifié par RP-HPLC (C18, gradient ACN/TFA) par comparaison avec les 20 standards PTH-aminoacides.\n\n\u003Cstrong>Performance et limitations\u003C/strong>. Le rendement par cycle atteint 95-98% dans des conditions optimales, mais chute progressivement avec les erreurs cumulatives (lag, carry-over, oxydation), limitant le séquençage utile à 30-50 cycles. Les limitations majeures sont : (1) N-terminal bloqué (pyroGlu, acétylation, N-formylation, myristoylation) empêchant le couplage ; (2) résidus problématiques (Cys oxydé, Ser/Thr phosphorylé, Trp sensible à l'oxydation acide) ; (3) sensibilité modeste (picomoles). Les automates \u003Cem>Applied Biosystems 491, Shimadzu PPSQ, Phenomenex Procise\u003C/em> réalisent ~1 cycle/heure.\n\n\u003Cstrong>Place actuelle\u003C/strong>. Détrônée pour le séquençage de novo par la \u003Cem>spectrométrie de masse tandem MS/MS\u003C/em> (ESI/MALDI + collision CID/HCD/ETD, logiciels PEAKS, de Novo, MaxQuant), la dégradation d'Edman reste utilisée en contrôle qualité QC pharmaceutique (USP <1055>, validation de lots API peptidiques), détection de clivage protéolytique de novo (biomarqueurs), et caractérisation de peptides synthétiques pour confirmer l'orientation N→C sans ambiguïté.",[],[],"Dégradation d'Edman : méthode classique de séquençage N-terminal des peptides par le réactif PITC. Référence historique.",{"de":15,"en":16,"es":17},"Edman-Abbau","Edman Degradation","Degradación de Edman",{"de":19,"en":20,"es":21},"\u003Cstrong>Der Edman-Abbau\u003C/strong> ist eine \u003Cem>chemische Methode der N-terminalen Sequenzierung\u003C/em> von Peptiden und Proteinen, die 1950 von dem schwedischen Biochemiker \u003Cem>Pehr Edman\u003C/em> entwickelt wurde. Sie beruht auf der schrittweisen, zyklusweisen Abspaltung des N-terminalen Rests eines Peptids, ohne den Rest der Kette zu beschädigen, und ermöglicht so die Identifizierung der ersten 30-50 Aminosäuren einer Polypeptidsequenz.\n\n\u003Cstrong>Chemisches Prinzip\u003C/strong>. Jeder Edman-Zyklus umfasst drei Schritte: (1) \u003Cem>Kupplung\u003C/em> — Phenylisothiocyanat (\u003Cstrong>PITC\u003C/strong>, Edman-Reagenz) reagiert im basischen Milieu (Trimethylamin oder Pyridin) mit dem freien N-terminalen Amin zu \u003Cem>Phenylthiocarbamat\u003C/em> (PTC); (2) \u003Cem>Abspaltung\u003C/em> — wasserfreie Trifluoressigsäure (\u003Cem>TFA\u003C/em>) bewirkt eine intramolekulare Cyclisierung mit dem Peptidstickstoff und setzt den N-terminalen Rest als \u003Cem>Anilinothiazolinon\u003C/em> (ATZ) frei; (3) \u003Cem>Umwandlung und Identifizierung\u003C/em> — das instabile ATZ wird durch Erhitzen in wässrig-saurem Milieu in das stabile \u003Cem>Phenylthiohydantoin\u003C/em> (PTH) überführt, anschließend wird das PTH-Aminosäurederivat mittels RP-HPLC (C18, ACN/TFA-Gradient) durch Vergleich mit den 20 PTH-Aminosäure-Standards identifiziert.\n\n\u003Cstrong>Leistung und Grenzen\u003C/strong>. Die Zyklusausbeute erreicht unter optimalen Bedingungen 95-98%, sinkt jedoch durch kumulative Fehler (Verzögerung, Verschleppung, Oxidation) fortschreitend ab, was die nutzbare Sequenzierung auf 30-50 Zyklen begrenzt. Wesentliche Einschränkungen: (1) blockierter N-Terminus (pyroGlu, Acetylierung, N-Formylierung, Myristoylierung), der die Kupplung verhindert; (2) problematische Reste (oxidiertes Cys, phosphoryliertes Ser/Thr, gegenüber saurer Oxidation empfindliches Trp); (3) mäßige Empfindlichkeit (Pikomol). Die Automaten \u003Cem>Applied Biosystems 491, Shimadzu PPSQ, Phenomenex Procise\u003C/em> leisten ~1 Zyklus/Stunde.\n\n\u003Cstrong>Heutige Rolle\u003C/strong>. Für die De-novo-Sequenzierung durch die \u003Cem>Tandem-Massenspektrometrie MS/MS\u003C/em> verdrängt (ESI/MALDI + CID/HCD/ETD-Kollision, Software PEAKS, de Novo, MaxQuant), wird der Edman-Abbau weiterhin in der pharmazeutischen Qualitätskontrolle (USP <1055>, Chargenfreigabe von Peptid-Wirkstoffen), beim Nachweis neuartiger proteolytischer Spaltungen (Biomarker) und bei der Charakterisierung synthetischer Peptide eingesetzt, um die N→C-Orientierung eindeutig zu bestätigen.","\u003Cstrong>Edman degradation\u003C/strong> is a \u003Cem>chemical method of N-terminal sequencing\u003C/em> of peptides and proteins, developed by Swedish biochemist \u003Cem>Pehr Edman\u003C/em> in 1950. It relies on sequential cycle-by-cycle cleavage of the N-terminal residue of a peptide without damaging the rest of the chain, allowing identification of the first 30-50 amino acids of a polypeptide sequence.\n\n\u003Cstrong>Chemical principle\u003C/strong>. Each Edman cycle comprises three steps: (1) \u003Cem>coupling\u003C/em> — phenylisothiocyanate (\u003Cstrong>PITC\u003C/strong>, Edman reagent) reacts with the free N-terminal amine in basic medium (trimethylamine or pyridine) to form \u003Cem>phenylthiocarbamate\u003C/em> (PTC); (2) \u003Cem>cleavage\u003C/em> — anhydrous trifluoroacetic acid (\u003Cem>TFA\u003C/em>) induces intramolecular cyclisation with peptide nitrogen and releases the N-terminal residue as \u003Cem>anilinothiazolinone\u003C/em> (ATZ); (3) \u003Cem>conversion and identification\u003C/em> — unstable ATZ is converted to stable \u003Cem>phenylthiohydantoin\u003C/em> (PTH) by heating in aqueous acidic medium, then the PTH-amino acid derivative is identified by RP-HPLC (C18, ACN/TFA gradient) by comparison with the 20 PTH-amino acid standards.\n\n\u003Cstrong>Performance and limitations\u003C/strong>. Cycle yield reaches 95-98% under optimal conditions, but drops progressively with cumulative errors (lag, carry-over, oxidation), limiting useful sequencing to 30-50 cycles. Major limitations: (1) blocked N-terminus (pyroGlu, acetylation, N-formylation, myristoylation) preventing coupling; (2) problematic residues (oxidised Cys, phosphorylated Ser/Thr, Trp sensitive to acidic oxidation); (3) modest sensitivity (picomoles). \u003Cem>Applied Biosystems 491, Shimadzu PPSQ, Phenomenex Procise\u003C/em> automates perform ~1 cycle/hour.\n\n\u003Cstrong>Current role\u003C/strong>. Displaced for de novo sequencing by \u003Cem>tandem mass spectrometry MS/MS\u003C/em> (ESI/MALDI + CID/HCD/ETD collision, PEAKS, de Novo, MaxQuant software), Edman degradation remains used in pharmaceutical QC control (USP <1055>, peptide API batch validation), de novo proteolytic cleavage detection (biomarkers), and characterisation of synthetic peptides to confirm N→C orientation without ambiguity.","\u003Cstrong>La degradación de Edman\u003C/strong> es un \u003Cem>método químico de secuenciación N-terminal\u003C/em> de péptidos y proteínas, desarrollado por el bioquímico sueco \u003Cem>Pehr Edman\u003C/em> en 1950. Se basa en la escisión secuencial, ciclo a ciclo, del residuo N-terminal de un péptido sin dañar el resto de la cadena, lo que permite identificar los primeros 30-50 aminoácidos de una secuencia polipeptídica.\n\n\u003Cstrong>Principio químico\u003C/strong>. Cada ciclo de Edman comprende tres etapas: (1) \u003Cem>acoplamiento\u003C/em>: el fenilisotiocianato (\u003Cstrong>PITC\u003C/strong>, reactivo de Edman) reacciona con la amina N-terminal libre en medio básico (trimetilamina o piridina) para formar \u003Cem>feniltiocarbamato\u003C/em> (PTC); (2) \u003Cem>escisión\u003C/em>: el ácido trifluoroacético anhidro (\u003Cem>TFA\u003C/em>) induce una ciclación intramolecular con el nitrógeno peptídico y libera el residuo N-terminal en forma de \u003Cem>anilinotiazolinona\u003C/em> (ATZ); (3) \u003Cem>conversión e identificación\u003C/em>: la ATZ, inestable, se convierte en \u003Cem>feniltiohidantoína\u003C/em> (PTH), estable, por calentamiento en medio ácido acuoso, y después el derivado PTH-aminoácido se identifica por RP-HPLC (C18, gradiente ACN/TFA) por comparación con los 20 patrones de PTH-aminoácidos.\n\n\u003Cstrong>Rendimiento y limitaciones\u003C/strong>. El rendimiento por ciclo alcanza el 95-98% en condiciones óptimas, pero disminuye progresivamente con la acumulación de errores (retraso, arrastre, oxidación), lo que limita la secuenciación útil a 30-50 ciclos. Principales limitaciones: (1) extremo N-terminal bloqueado (pyroGlu, acetilación, N-formilación, miristoilación), que impide el acoplamiento; (2) residuos problemáticos (Cys oxidada, Ser/Thr fosforiladas, Trp sensible a la oxidación ácida); (3) sensibilidad modesta (picomoles). Los secuenciadores automáticos \u003Cem>Applied Biosystems 491, Shimadzu PPSQ, Phenomenex Procise\u003C/em> realizan ~1 ciclo/hora.\n\n\u003Cstrong>Papel actual\u003C/strong>. Desplazada en la secuenciación de novo por la \u003Cem>espectrometría de masas en tándem MS/MS\u003C/em> (ESI/MALDI + colisión CID/HCD/ETD, software PEAKS, de Novo, MaxQuant), la degradación de Edman se sigue utilizando en el control de calidad farmacéutico (USP <1055>, validación de lotes de API peptídicos), en la detección de novo de escisiones proteolíticas (biomarcadores) y en la caracterización de péptidos sintéticos para confirmar sin ambigüedad la orientación N→C.","published","2026-04-23T16:14:10.442465+00:00","2026-09-25T10:28:05.538212+00:00",{"de":26,"en":27,"es":28},"Edman-Abbau: klassische Methode der N-terminalen Peptidsequenzierung mit dem Reagenz PITC. Historische Referenz.","Edman degradation: classic N-terminal peptide sequencing method using PITC reagent. Historical reference.","Degradación de Edman: método clásico de secuenciación N-terminal de péptidos con el reactivo PITC. Referencia histórica.","lab",[],[],[]]